바이오 빅데이터! 생물정보학 전문가 꿈나무의 도전 #스몰스텝

스몰스텝에는 생물정보학 (Bioinformatics) 전문가로 성장해 가는 박사과정 꿈나무 전문가가 있습니다! 게놈에 대한 정의부터 일반인에게 알기 쉽게 연구 분야를 풀어준 우리 멤버의 성장을 함께 응원해 주세요!

 

 

바이오 빅데이터! 생물정보학 전문가를 꿈꾸며

2023년 9월 4일 스몰스텝 4기 4회 세션에 진행한 스몰스텝 모임 소감을 공유합니다.

 

 

스몰스텝 모임이 궁금하시면?

[💕 Small Steps, Bright Future] - 아름다운 세상, 밝은 미래를 꿈꾸는 청년모임 '스몰스텝'

아름다운 세상, 밝은 미래를 꿈꾸는 청년모임 '스몰스텝'

 

 

 

 

Bioinformatics! 스몰스텝을 밟아 전문가로!

발표자:

 

OO훈

 

Bioinformatics는 여러 분야가 협업하여 데이터 기반으로 생명과학연구를 주도하는 분야입니다. 우리는 게놈(genome)이라는 거대한 책을 읽기 위해 시퀀싱이라는 방법을 사용합니다. 더욱 빨라진 시퀀싱 기술, 그리고 낮아진 시퀀싱 비용은 빅데이터의 시대를 열었습니다. 높아진 데이터 접근성은 이를 처리하기 위한 Bioinformatics의 수요를 증가시켰습니다.
오늘은 Bioinformatics의 데이터 처리과정 중에서 de novo assembly와 mapping(alignment)를 소개했습니다. de novo assembly의 경우, 레퍼런스가 되는 게놈이 없을 경우 처음부터 마치 퍼즐과 같이 DNA 염기서열을 조립하는 과정이라고 보시면 됩니다. 이 과정은 계산량이 많고 시간도 오래 걸립니다. 이를 통해 우리는 레퍼런스가 되는 인간 게놈 지도를 얻을 수 있는 것입니다. 우리는 이 서열을 이용하여 비교하는 작업을 통해 빠르게 분석을 진행할 수 있는데 이를 mapping, 다른 말로 alignment라고 합니다. mapping이 완료되면 돌연변이와 같은 필요한 정보를 얻을 수 있습니다.

 

참여자 소감

정OO

Bioinformatics, OO이가 걸어온 학문 분야를 게놈의 정의부터 차근차근 쉽게 설명해 주어, 바이오 빅데이터가 무엇인지 알게 되었습니다. OO이가 어엿한 전문가로 성장해 가는 스몰스텝을 바라보는 것이 참 뿌듯했습니다. 무엇보다, DNA 추출 없이 돌연변이를 얻어내는 기술과 프라이머 간 상호작용을 최소화하는 소프트웨어를 개발해가고 있는 OO 이를 보며, 왜 과학자를 전폭적으로 지원해야 하고 과학이 세상을 변화시키는 힘인지를 절실히 느낄 수 있는 시간이었습니다. 준비해 준 OO이 고맙고 앞으로의 여정도 항상 응원합니다! 😀 😄

성OO:
게놈 시퀀싱 비용을 줄이기 위한 연구들이 이루어진다는 것 자체가 생소했는데, 디테일한 내용을 쉽게 전달해 주셔서 너무 재밌게 잘 들었습니다. 환자와 의사를 위한 연구가 진통 속에서 결실을 맺고 있다는 게 느껴졌고, 그 속에서 스몰스텝을 해나가시는 모습이 감명 깊었습니다.

개인적으로는 맞춤형 치료제를 개발하는 데 데이터가 어떻게 활용되는지 궁금했는데, OO님이 직접 환자들의 표본을 로봇을 통해 분석하는 과정을 공유해 주셔서 많은 참고가 되었습니다.


임OO:
저도 대학원 진학 전 생물을 깊게 공부했던 경험이 있는데, 그때는 그냥 NGS 같은 것이 있다 정도로 두고 넘어갔던 기억이 있습니다. 오랜만에 과거의 기억을 상기시키는 시간이었고, 또 실생활과 상업적으로 어떻게 개념이 적용되고 이용될 수 있는지를 알 수 있는 색다른 시간이었던 것 같습니다. 인간 게놈 프로젝트는 착실하게 진행되어 왔다는 것이 느껴져 새삼 신기하네요. 살아있는 동안 인간의 DNA 지도가 해석되었으면 하는 바람입니다. OO님 좋은 강의 내용 공유해 주셔서 감사드립니다.


읽어 볼만한 자료

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스몰스텝의 활동

 

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